继陈水扁之后，台湾又一卸任最高领导人涉贪被起诉。检方特侦组6月30日宣布，将以“侵占公有财物与洗钱”等罪名，起诉李登辉及台湾综合研究院创办人刘泰英。特侦组发言人表示，李登辉涉案金额高达779万美元，最高可被判无期徒刑。
口谕成证据
检方在起诉书中指出，1998年至1999年间，在李登辉授意与运作下，刘泰英将一笔2.5亿元新台币的“秘密外交”款项挪作他用，并从中私吞了约44万美元。
李登辉1994年在任时，成立“奉天专案”基金，该基金十分机密，非“总统”不能动用。同一年，李登辉出访南非，从“奉天”基金中拿出1050万美元来“巩固邦谊”(俗称“巩案”)。
1998年，李登辉与时任“国安局长”的殷宗文(已故)密谋，由“国安局”出面，向“外交部”索要这笔“巩案”垫款。不知“奉天专案”为何物的“外交部”于是把钱交给了“国安局”。孰料，这笔钱经过“漂洗”，大部分流入了由刘泰英任大掌柜的台综院。
没有证据显示李登辉亲手拿钱，但台综院是李登辉手底下四大智库之一，李卸任后任台综院荣誉董事长，主要工作就是“出访”。台综院还在润泰大楼里为李登辉设立了办公室、纪念图书馆与文物室。
“国安密账案”2002年遭媒体揭露后，殷宗文、刘泰英等人曾与李登辉密议补正公文，但李登辉拒绝，指示以撰写报告、备忘录等文件代替即可。
颇为讽刺的是，正是殷宗文制作的备忘录，成了起诉李登辉的关键。备忘录上有“巩案经费垫款来龙去脉我都知道，但现在要补办公文、要我来批，并不适宜，我也不会同意”、“巩案余款支持台综院第四所所需是事实，刘泰英也确实收到这笔款项，必要时请刘先生出面说明”等话。就连李登辉也没预料到，情报头子为求事发自保，会将他的口谕记录在案。
政坛大地震
李登辉曾在台执政12年，是只手遮天的人物。在他任上，台湾地区领导人的选举方式改为全民投票，下台之前，他亲手扶持陈水扁上台，让台湾经历了首次政党轮替。如今，88岁的“台独教父”，在绿营仍有独一无二的威望与影响。岛内媒体惊呼，李登辉被起诉，引发了“政坛地震”。
再一个震撼是，自诩“台湾之子”的陈水扁已被证明是大贪污之后，号称“民主之父”的李登辉同样晚节不保，台湾史上首位和第二位所谓“民选总统”，竟然都因贪污落马。连民进党“四大天王”之一的吕秀莲都说，这是全体台湾人民共同的耻辱。
第二个震撼是，李登辉被起诉，让岛内蓝绿对立再度高涨，连带波及2012年“大选”选情。绿营纷纷把矛头指向蓝营及马英九，认为这是对“本土力量”的迫害，“台湾人总统”都要被起诉，只有“外省人总统”不会被起诉。民进党主席蔡英文则火力全开，指责国民党“挟怨报复、选举操作、政治追杀”，逼得马英九立即召开记者会严正否认，表示尊重司法，绝对没有介入该案。
有国民党“立委”私下估测，李登辉事件将使绿营更加团结，对国民党未必是好事。不过“立委”邱毅认为，深绿基本盘本来就已凝聚到顶点，所以这件事可以重新点燃蓝营对马英九的热情。
对于此案，李登辉表示“莫名其妙”，“快90岁了，不怕迫害”。他在1日与蔡英文同台时，高喊“弃马保台”，“只有换领导人，没别的办法了！”有台湾媒体指出，鉴于李登辉将有可能成为陈水扁的狱友，所以，李登辉力挺蔡英文，很可能预先为自己将来获“特赦”做准备。
扁李恩仇录
李登辉被起诉，也让“扁李恩仇录”再续前文。
2008年9月，陈水扁因洗钱案接受调查时，为证明前任也和他一样，向检方告发李登辉涉及5100万美元洗钱案并提供相关资料，李登辉当时怒斥陈水扁：“自己死就拖大家一起死。”
绿营大骂国民党对李登辉“政治追杀”时，国民党立即回应“是陈水扁告李登辉，却算到国民党头上，让人啼笑皆非”。人在狱中的陈水扁2日透过女儿陈幸妤对外澄清，李登辉被起诉与他无关，也不是他告发的，他当时在法庭所讲的是新瑞都案外案文件，不是“国安密账案”。
陈水扁告倒李登辉，这次确实没发生，但很可能发生在下一次。特侦组证实，陈水扁所告的是李登辉另一件案子，据陈水扁提供的资料显示，李登辉在1998年，将“国安”资金近10亿元新台币，分34笔辗转汇往新加坡等国，最后流向不明。目前，特侦组正与新加坡“司法互助”，追查这笔密账。
《中国时报》评论说，扁、李两人曾经是“政坛父子”，后来却形同陌路，为了个人利益而上演“政治弑父”剧，显露人性的卑劣与丑陋。(本报记者 王平)
